Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms