Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms