Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms