Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMF1P82094 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMF1P82094 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms