Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX1P78337 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms