Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms