Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms