Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms