Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms