Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC8P31273 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC8P31273 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms