Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms