Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPREP23469 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms