Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPRBP23467 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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