Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms