Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms