Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms