Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms