Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms