Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms