Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TISP43B9A030 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TISP43B9A030 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms