Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
B4DXG7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
B4DXG7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
B4DXG7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms