Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms