Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA6BA6NDN3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms