Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms