Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms