Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms