Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPZ2Q9P299 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms