Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms