Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM5Q9C035 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms