Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms