Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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