Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA4

MS4A14, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 14, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A14Q96JA4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MS4A14Q96JA4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms