Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms