Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms