Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms