Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LLGL2Q6P1M3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms