Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms