Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms