Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms