Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms