Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms