Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms