Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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