Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRIM16LQ309B1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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