Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms