Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms