Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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