Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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