Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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