Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms